新疆医科大学有4个校区，分别是本部、护理学院、临床医学院、厚博学院。详细地址为：1、本部：新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市新医路393号；2、护理学院：新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市沙依巴克区友好南路168号；3、临床医学院：新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市天山区胜利路558号；4、厚博学院：新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市新市区鲤鱼山公园4号。
截止2016年3月，全校教职工16175人，校本部教职工1550人。专任教师902名，临床教师1212人。全校教授226人，副教授685人。
6人入选国家“新世纪百千万人才工程国家级人选”，4人获新世纪优秀人才支持计划，58位专家享受政府特殊津贴，5人获卫生部有突出贡献中青年专家，1人获国家杰出青年基金奖，1名国家级教学名师，2人获国家何梁何利基金奖，37人获得自治区突出贡献优秀专家称号，15名自治区级教学名师，2009年、2010年连续获得2项国家科技进步奖二等奖。
